Projet AlgeThera

Algèbre des molécules thérapeutiques

A propos du projet

Pour concevoir une nouvelle molécule pharmaceutique, les recherches in vitro identifient d'abord des cibles thérapeutiques sur lesquelles ces molécules doivent être actives, donc les liens qu'elles doivent posséder avec d'autres protéines, mais aussi leur activité au niveau cellulaire qui est très difficilement compatible. Les biochimistes médicinaux conçoivent cette double optimisation de manière artisanale, sur la base de leur expertise, par analogie avec d'autres molécules ayant, en partie, des propriétés similaires. Des logiciels de simulation moléculaire aident la conception en prédisant les affinités, préalablement subodorées par les experts biochimistes. Nous proposons une approche entièrement nouvelle pour systématiser cette conception préalable de molécules pharmaceutiques et orienter les experts en amont dans leur recherche de composition moléculaire : utiliser des déconstructions-reconstructions algébriques de protéines, pilotées par les propriétés recherchées, partant des bases de données largement disponibles de molécules pharmaceutiques ayant déjà fait leurs preuves.